Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
Tomm40Q9QYA2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Tomm40Q9QYA2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,14■□□□□ 0,81
Tomm40Q9QYA2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
Tomm40Q9QYA2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,09■□□□□ 0,81
Tomm40Q9QYA2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Tomm40Q9QYA2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20,08■□□□□ 0,8
Tomm40Q9QYA2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
Tomm40Q9QYA2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,06■□□□□ 0,8
Tomm40Q9QYA2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20,04■□□□□ 0,8
Tomm40Q9QYA2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
Tomm40Q9QYA2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19,99■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19,98■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,97■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Tomm40Q9QYA2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Tomm40Q9QYA2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Tomm40Q9QYA2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Tomm40Q9QYA2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19,93■□□□□ 0,78
Tomm40Q9QYA2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
Tomm40Q9QYA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19,91■□□□□ 0,78
Tomm40Q9QYA2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Tomm40Q9QYA2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19,78■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Tomm40Q9QYA2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19,74■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Tomm40Q9QYA2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19,7■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Tomm40Q9QYA2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,64■□□□□ 0,73
Tomm40Q9QYA2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,63■□□□□ 0,73
Tomm40Q9QYA2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Tomm40Q9QYA2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Tomm40Q9QYA2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Tomm40Q9QYA2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,73
Tomm40Q9QYA2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,58■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,54■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,52■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,72
Tomm40Q9QYA2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Tomm40Q9QYA2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Tomm40Q9QYA2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19,51■□□□□ 0,71
Tomm40Q9QYA2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,5■□□□□ 0,71
Tomm40Q9QYA2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,3 ms