Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Nphp1Q9QY53 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Nphp1Q9QY53 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,52■■■□□ 2,8
Nphp1Q9QY53 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Nphp1Q9QY53 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Nphp1Q9QY53 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Nphp1Q9QY53 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Nphp1Q9QY53 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Nphp1Q9QY53 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Nphp1Q9QY53 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Nphp1Q9QY53 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Nphp1Q9QY53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Nphp1Q9QY53 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Nphp1Q9QY53 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Nphp1Q9QY53 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Nphp1Q9QY53 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,31■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Nphp1Q9QY53 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Nphp1Q9QY53 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Nphp1Q9QY53 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Nphp1Q9QY53 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Nphp1Q9QY53 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,19■■■□□ 2,74
Nphp1Q9QY53 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
Nphp1Q9QY53 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Nphp1Q9QY53 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Nphp1Q9QY53 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Nphp1Q9QY53 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Nphp1Q9QY53 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
Nphp1Q9QY53 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,11■■■□□ 2,73
Nphp1Q9QY53 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Nphp1Q9QY53 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Nphp1Q9QY53 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Nphp1Q9QY53 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Nphp1Q9QY53 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Nphp1Q9QY53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Nphp1Q9QY53 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Nphp1Q9QY53 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,72
Nphp1Q9QY53 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC32,01■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,99■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31,96■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Nphp1Q9QY53 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Nphp1Q9QY53 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31,89■■■□□ 2,7
Nphp1Q9QY53 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31,88■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31,84■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Nphp1Q9QY53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,78■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,68
Nphp1Q9QY53 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,74■■■□□ 2,67
Nphp1Q9QY53 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Nphp1Q9QY53 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Nphp1Q9QY53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,7■■■□□ 2,67
Nphp1Q9QY53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,7■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,67■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31,65■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,66
Nphp1Q9QY53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31,6■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,65
Nphp1Q9QY53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Nphp1Q9QY53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Nphp1Q9QY53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31,56■■■□□ 2,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms