Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 BOP1-204ENST00000569403 651 ntTSL 423.98■■□□□ 1.434e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 TMEM259-208ENST00000592052 1637 nt23.08■■□□□ 1.284e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-211ENST00000483015 1058 ntTSL 322.96■■□□□ 1.274e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-205ENST00000464570 968 ntTSL 321.64■■□□□ 1.054e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 221.26■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-208ENST00000473511 1332 ntTSL 521.1■□□□□ 0.974e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-202ENST00000553729 579 ntTSL 320.56■□□□□ 0.884e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.744e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 519.4■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-227ENST00000511910 584 ntTSL 219.17■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.664e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 518.55■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 TMEM259-205ENST00000586704 2538 ntTSL 518.42■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.494e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 TMEM259-211ENST00000593068 1965 ntTSL 518.08■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.464e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-206ENST00000555174 1702 ntTSL 1 (best)17.61■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 216.78■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 216.7■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-205ENST00000554735 3108 nt16.52■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 GIGYF1-203ENST00000471340 478 ntTSL 515.51■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -04e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 512.91□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-204ENST00000554694 866 ntTSL 1 (best)12.21□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 DIO3OS-210ENST00000557109 686 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-202ENST00000460563 1045 ntTSL 59.88□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 29.68□□□□□ -0.864e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 AC019117.2-203ENST00000636703 972 ntTSL 59.54□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 GNG7-202ENST00000587867 723 ntTSL 58.71□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 58.19□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-203ENST00000463817 853 ntTSL 28.19□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 AC019117.2-202ENST00000635900 1476 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 26.97□□□□□ -1.294e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 36.41□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.564e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.874e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 AC019117.2-201ENST00000419463 837 ntTSL 22.98□□□□□ -1.934e-7■■■■■ 68.8
SDAD1Q9NVU7 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 227.28■■□□□ 1.962e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 227.28■■□□□ 1.962e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 424.1■■□□□ 1.452e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 524■■□□□ 1.432e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.162e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 217.82■□□□□ 0.442e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 217.22■□□□□ 0.352e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 516.68■□□□□ 0.262e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 412.46□□□□□ -0.412e-23■■■■■ 66.4
SDAD1Q9NVU7 KSR1-211ENST00000580163 479 ntTSL 320.37■□□□□ 0.852e-9■■■■■ 66
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-205ENST00000462319 433 ntTSL 313.12□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 66
SDAD1Q9NVU7 KSR1-208ENST00000579309 343 ntTSL 55.44□□□□□ -1.542e-9■■■■■ 66
SDAD1Q9NVU7 AAMDC-205ENST00000526164 726 ntTSL 214.63□□□□□ -0.078e-10■■■■■ 64.2
SDAD1Q9NVU7 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.548e-10■■■■■ 64.2
SDAD1Q9NVU7 AAMDC-201ENST00000304716 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.628e-10■■■■■ 64.2
SDAD1Q9NVU7 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.658e-10■■■■■ 64.2
SDAD1Q9NVU7 AAMDC-212ENST00000630098 542 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.848e-10■■■■■ 64.2
SDAD1Q9NVU7 AAMDC-208ENST00000529666 440 ntTSL 36.71□□□□□ -1.348e-10■■■■■ 64.2
SDAD1Q9NVU7 FAM182B-203ENST00000424021 605 ntTSL 513.34□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 64.1
SDAD1Q9NVU7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-204ENST00000428005 1572 ntTSL 1 (best)21.7■■□□□ 1.063e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 TMC6-206ENST00000586271 970 ntTSL 217.79■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.183e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-208ENST00000437266 3407 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.173e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.163e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.073e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-209ENST00000438530 3825 ntTSL 1 (best)15.27■□□□□ 0.043e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.013e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-215ENST00000457377 3600 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.023e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.13e-12■■■■■ 63.9
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-207ENST00000473551 2108 ntTSL 219.55■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 62.5
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 62.5
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 62.5
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-209ENST00000487793 863 ntTSL 216.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 62.5
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 62.5
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 62.5
SDAD1Q9NVU7 ARVCF-210ENST00000492625 631 ntTSL 313.34□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 62.5
SDAD1Q9NVU7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.187e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.467e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.357e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.337e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.327e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.047e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 LGALS3BP-209ENST00000588205 581 ntTSL 314.55□□□□□ -0.087e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 YARS-209ENST00000490826 2178 ntTSL 214.34□□□□□ -0.117e-10■■■■■ 61.7
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 46.8 ms