Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lgi1Q9JIA1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgi1Q9JIA1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lgi1Q9JIA1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgi1Q9JIA1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lgi1Q9JIA1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lgi1Q9JIA1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lgi1Q9JIA1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgi1Q9JIA1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lgi1Q9JIA1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lgi1Q9JIA1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgi1Q9JIA1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lgi1Q9JIA1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lgi1Q9JIA1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lgi1Q9JIA1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lgi1Q9JIA1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgi1Q9JIA1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lgi1Q9JIA1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lgi1Q9JIA1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lgi1Q9JIA1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lgi1Q9JIA1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lgi1Q9JIA1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lgi1Q9JIA1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgi1Q9JIA1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgi1Q9JIA1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lgi1Q9JIA1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lgi1Q9JIA1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lgi1Q9JIA1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lgi1Q9JIA1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lgi1Q9JIA1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lgi1Q9JIA1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgi1Q9JIA1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lgi1Q9JIA1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lgi1Q9JIA1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lgi1Q9JIA1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lgi1Q9JIA1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lgi1Q9JIA1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lgi1Q9JIA1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lgi1Q9JIA1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgi1Q9JIA1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lgi1Q9JIA1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lgi1Q9JIA1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgi1Q9JIA1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi1Q9JIA1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi1Q9JIA1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi1Q9JIA1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgi1Q9JIA1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgi1Q9JIA1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgi1Q9JIA1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms