Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Lgi1Q9JIA1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lgi1Q9JIA1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lgi1Q9JIA1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lgi1Q9JIA1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Lgi1Q9JIA1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lgi1Q9JIA1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Lgi1Q9JIA1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Lgi1Q9JIA1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Lgi1Q9JIA1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Lgi1Q9JIA1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lgi1Q9JIA1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lgi1Q9JIA1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Lgi1Q9JIA1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lgi1Q9JIA1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Lgi1Q9JIA1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Lgi1Q9JIA1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lgi1Q9JIA1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lgi1Q9JIA1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Lgi1Q9JIA1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lgi1Q9JIA1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lgi1Q9JIA1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lgi1Q9JIA1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lgi1Q9JIA1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lgi1Q9JIA1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lgi1Q9JIA1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lgi1Q9JIA1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lgi1Q9JIA1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lgi1Q9JIA1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lgi1Q9JIA1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lgi1Q9JIA1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lgi1Q9JIA1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Lgi1Q9JIA1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lgi1Q9JIA1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lgi1Q9JIA1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lgi1Q9JIA1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Lgi1Q9JIA1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lgi1Q9JIA1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lgi1Q9JIA1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lgi1Q9JIA1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lgi1Q9JIA1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lgi1Q9JIA1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lgi1Q9JIA1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lgi1Q9JIA1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lgi1Q9JIA1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lgi1Q9JIA1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lgi1Q9JIA1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lgi1Q9JIA1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lgi1Q9JIA1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lgi1Q9JIA1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lgi1Q9JIA1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lgi1Q9JIA1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lgi1Q9JIA1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lgi1Q9JIA1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lgi1Q9JIA1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Lgi1Q9JIA1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lgi1Q9JIA1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lgi1Q9JIA1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lgi1Q9JIA1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lgi1Q9JIA1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lgi1Q9JIA1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lgi1Q9JIA1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lgi1Q9JIA1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lgi1Q9JIA1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lgi1Q9JIA1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lgi1Q9JIA1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lgi1Q9JIA1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lgi1Q9JIA1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lgi1Q9JIA1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lgi1Q9JIA1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lgi1Q9JIA1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lgi1Q9JIA1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lgi1Q9JIA1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Lgi1Q9JIA1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgi1Q9JIA1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgi1Q9JIA1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lgi1Q9JIA1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lgi1Q9JIA1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lgi1Q9JIA1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lgi1Q9JIA1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lgi1Q9JIA1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lgi1Q9JIA1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lgi1Q9JIA1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lgi1Q9JIA1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lgi1Q9JIA1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lgi1Q9JIA1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lgi1Q9JIA1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lgi1Q9JIA1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lgi1Q9JIA1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lgi1Q9JIA1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lgi1Q9JIA1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lgi1Q9JIA1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lgi1Q9JIA1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lgi1Q9JIA1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Lgi1Q9JIA1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lgi1Q9JIA1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lgi1Q9JIA1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lgi1Q9JIA1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lgi1Q9JIA1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lgi1Q9JIA1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms