Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pus3Q9JI38 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pus3Q9JI38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pus3Q9JI38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pus3Q9JI38 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pus3Q9JI38 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pus3Q9JI38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pus3Q9JI38 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Pus3Q9JI38 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pus3Q9JI38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pus3Q9JI38 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pus3Q9JI38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pus3Q9JI38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pus3Q9JI38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pus3Q9JI38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Pus3Q9JI38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pus3Q9JI38 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pus3Q9JI38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Pus3Q9JI38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Pus3Q9JI38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pus3Q9JI38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Pus3Q9JI38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Pus3Q9JI38 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pus3Q9JI38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pus3Q9JI38 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pus3Q9JI38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Pus3Q9JI38 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pus3Q9JI38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Pus3Q9JI38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pus3Q9JI38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Pus3Q9JI38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pus3Q9JI38 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pus3Q9JI38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pus3Q9JI38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Pus3Q9JI38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pus3Q9JI38 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Pus3Q9JI38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pus3Q9JI38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Pus3Q9JI38 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pus3Q9JI38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pus3Q9JI38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Pus3Q9JI38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pus3Q9JI38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Pus3Q9JI38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pus3Q9JI38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Pus3Q9JI38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pus3Q9JI38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Pus3Q9JI38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pus3Q9JI38 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pus3Q9JI38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pus3Q9JI38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pus3Q9JI38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pus3Q9JI38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pus3Q9JI38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pus3Q9JI38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pus3Q9JI38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Pus3Q9JI38 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms