Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nif3l1Q9EQ80 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nif3l1Q9EQ80 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nif3l1Q9EQ80 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nif3l1Q9EQ80 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nif3l1Q9EQ80 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nif3l1Q9EQ80 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Nif3l1Q9EQ80 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nif3l1Q9EQ80 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nif3l1Q9EQ80 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nif3l1Q9EQ80 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nif3l1Q9EQ80 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nif3l1Q9EQ80 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nif3l1Q9EQ80 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nif3l1Q9EQ80 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nif3l1Q9EQ80 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nif3l1Q9EQ80 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nif3l1Q9EQ80 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nif3l1Q9EQ80 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nif3l1Q9EQ80 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nif3l1Q9EQ80 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nif3l1Q9EQ80 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Nif3l1Q9EQ80 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nif3l1Q9EQ80 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nif3l1Q9EQ80 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nif3l1Q9EQ80 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nif3l1Q9EQ80 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nif3l1Q9EQ80 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nif3l1Q9EQ80 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nif3l1Q9EQ80 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nif3l1Q9EQ80 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nif3l1Q9EQ80 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nif3l1Q9EQ80 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nif3l1Q9EQ80 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nif3l1Q9EQ80 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nif3l1Q9EQ80 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Nif3l1Q9EQ80 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nif3l1Q9EQ80 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nif3l1Q9EQ80 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nif3l1Q9EQ80 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nif3l1Q9EQ80 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nif3l1Q9EQ80 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nif3l1Q9EQ80 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms