Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Clstn1Q9EPL2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,52
Clstn1Q9EPL2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Clstn1Q9EPL2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30,76■■■□□ 2,51
Clstn1Q9EPL2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Clstn1Q9EPL2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Clstn1Q9EPL2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Clstn1Q9EPL2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Clstn1Q9EPL2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Clstn1Q9EPL2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Clstn1Q9EPL2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Clstn1Q9EPL2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Clstn1Q9EPL2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Clstn1Q9EPL2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,5
Clstn1Q9EPL2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Clstn1Q9EPL2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Clstn1Q9EPL2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30,61■■■□□ 2,49
Clstn1Q9EPL2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Clstn1Q9EPL2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Clstn1Q9EPL2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,48
Clstn1Q9EPL2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Clstn1Q9EPL2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Clstn1Q9EPL2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Clstn1Q9EPL2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Clstn1Q9EPL2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Clstn1Q9EPL2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,47■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Clstn1Q9EPL2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Clstn1Q9EPL2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Clstn1Q9EPL2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Clstn1Q9EPL2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Clstn1Q9EPL2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,4■■■□□ 2,46
Clstn1Q9EPL2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Clstn1Q9EPL2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Clstn1Q9EPL2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Clstn1Q9EPL2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,36■■■□□ 2,45
Clstn1Q9EPL2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Clstn1Q9EPL2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Clstn1Q9EPL2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Clstn1Q9EPL2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Clstn1Q9EPL2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,44
Clstn1Q9EPL2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Clstn1Q9EPL2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Clstn1Q9EPL2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Clstn1Q9EPL2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Clstn1Q9EPL2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Clstn1Q9EPL2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Clstn1Q9EPL2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Clstn1Q9EPL2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Clstn1Q9EPL2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Clstn1Q9EPL2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Clstn1Q9EPL2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Clstn1Q9EPL2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Clstn1Q9EPL2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Clstn1Q9EPL2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Clstn1Q9EPL2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Clstn1Q9EPL2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Clstn1Q9EPL2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,97■■■□□ 2,39
Clstn1Q9EPL2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Clstn1Q9EPL2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Clstn1Q9EPL2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Clstn1Q9EPL2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Clstn1Q9EPL2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Clstn1Q9EPL2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Clstn1Q9EPL2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Clstn1Q9EPL2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms