Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem41aQ9D8U2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem41aQ9D8U2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem41aQ9D8U2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem41aQ9D8U2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem41aQ9D8U2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem41aQ9D8U2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem41aQ9D8U2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem41aQ9D8U2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem41aQ9D8U2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem41aQ9D8U2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem41aQ9D8U2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem41aQ9D8U2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem41aQ9D8U2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem41aQ9D8U2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem41aQ9D8U2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem41aQ9D8U2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem41aQ9D8U2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem41aQ9D8U2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem41aQ9D8U2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmem41aQ9D8U2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmem41aQ9D8U2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmem41aQ9D8U2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmem41aQ9D8U2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem41aQ9D8U2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmem41aQ9D8U2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem41aQ9D8U2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem41aQ9D8U2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem41aQ9D8U2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem41aQ9D8U2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem41aQ9D8U2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem41aQ9D8U2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem41aQ9D8U2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem41aQ9D8U2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem41aQ9D8U2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem41aQ9D8U2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem41aQ9D8U2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem41aQ9D8U2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem41aQ9D8U2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms