Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lin37Q9D8N6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lin37Q9D8N6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin37Q9D8N6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin37Q9D8N6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin37Q9D8N6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin37Q9D8N6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin37Q9D8N6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lin37Q9D8N6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Lin37Q9D8N6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin37Q9D8N6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lin37Q9D8N6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lin37Q9D8N6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin37Q9D8N6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin37Q9D8N6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lin37Q9D8N6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lin37Q9D8N6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lin37Q9D8N6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lin37Q9D8N6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lin37Q9D8N6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin37Q9D8N6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin37Q9D8N6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin37Q9D8N6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lin37Q9D8N6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lin37Q9D8N6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lin37Q9D8N6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lin37Q9D8N6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lin37Q9D8N6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lin37Q9D8N6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lin37Q9D8N6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lin37Q9D8N6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lin37Q9D8N6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lin37Q9D8N6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lin37Q9D8N6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lin37Q9D8N6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lin37Q9D8N6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lin37Q9D8N6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms