Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn22Q9D7U6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn22Q9D7U6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cldn22Q9D7U6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cldn22Q9D7U6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn22Q9D7U6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cldn22Q9D7U6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cldn22Q9D7U6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn22Q9D7U6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn22Q9D7U6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn22Q9D7U6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cldn22Q9D7U6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cldn22Q9D7U6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cldn22Q9D7U6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cldn22Q9D7U6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cldn22Q9D7U6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cldn22Q9D7U6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cldn22Q9D7U6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn22Q9D7U6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn22Q9D7U6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn22Q9D7U6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn22Q9D7U6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn22Q9D7U6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn22Q9D7U6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn22Q9D7U6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn22Q9D7U6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cldn22Q9D7U6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cldn22Q9D7U6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cldn22Q9D7U6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cldn22Q9D7U6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cldn22Q9D7U6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn22Q9D7U6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn22Q9D7U6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn22Q9D7U6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn22Q9D7U6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn22Q9D7U6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn22Q9D7U6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn22Q9D7U6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn22Q9D7U6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn22Q9D7U6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn22Q9D7U6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn22Q9D7U6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cldn22Q9D7U6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn22Q9D7U6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn22Q9D7U6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn22Q9D7U6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cldn22Q9D7U6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms