Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N2

Krtap26-1, Keratin-associated protein 26-1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap26-1Q9D7N2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Krtap26-1Q9D7N2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Krtap26-1Q9D7N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krtap26-1Q9D7N2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Krtap26-1Q9D7N2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krtap26-1Q9D7N2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Krtap26-1Q9D7N2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krtap26-1Q9D7N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Krtap26-1Q9D7N2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krtap26-1Q9D7N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Krtap26-1Q9D7N2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Krtap26-1Q9D7N2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Krtap26-1Q9D7N2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Krtap26-1Q9D7N2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Krtap26-1Q9D7N2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krtap26-1Q9D7N2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krtap26-1Q9D7N2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krtap26-1Q9D7N2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krtap26-1Q9D7N2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krtap26-1Q9D7N2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krtap26-1Q9D7N2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krtap26-1Q9D7N2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms