Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc130Q9D516 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc130Q9D516 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc130Q9D516 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc130Q9D516 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc130Q9D516 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc130Q9D516 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc130Q9D516 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc130Q9D516 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc130Q9D516 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc130Q9D516 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc130Q9D516 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc130Q9D516 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc130Q9D516 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc130Q9D516 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc130Q9D516 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc130Q9D516 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc130Q9D516 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc130Q9D516 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc130Q9D516 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc130Q9D516 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc130Q9D516 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc130Q9D516 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc130Q9D516 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.8 ms