Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamp5Q9D387 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamp5Q9D387 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamp5Q9D387 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamp5Q9D387 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lamp5Q9D387 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lamp5Q9D387 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lamp5Q9D387 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lamp5Q9D387 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lamp5Q9D387 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lamp5Q9D387 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lamp5Q9D387 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lamp5Q9D387 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Lamp5Q9D387 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lamp5Q9D387 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp5Q9D387 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lamp5Q9D387 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp5Q9D387 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lamp5Q9D387 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp5Q9D387 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lamp5Q9D387 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lamp5Q9D387 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lamp5Q9D387 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamp5Q9D387 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp5Q9D387 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Lamp5Q9D387 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms