Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf128Q9D304 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf128Q9D304 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf128Q9D304 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf128Q9D304 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf128Q9D304 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf128Q9D304 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf128Q9D304 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf128Q9D304 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf128Q9D304 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf128Q9D304 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf128Q9D304 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf128Q9D304 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf128Q9D304 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf128Q9D304 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf128Q9D304 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf128Q9D304 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf128Q9D304 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf128Q9D304 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf128Q9D304 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf128Q9D304 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf128Q9D304 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf128Q9D304 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf128Q9D304 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf128Q9D304 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf128Q9D304 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf128Q9D304 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf128Q9D304 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf128Q9D304 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf128Q9D304 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf128Q9D304 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms