Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hddc3Q9D114 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hddc3Q9D114 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Hddc3Q9D114 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Hddc3Q9D114 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hddc3Q9D114 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hddc3Q9D114 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hddc3Q9D114 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hddc3Q9D114 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hddc3Q9D114 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hddc3Q9D114 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hddc3Q9D114 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Hddc3Q9D114 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hddc3Q9D114 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hddc3Q9D114 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hddc3Q9D114 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hddc3Q9D114 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hddc3Q9D114 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hddc3Q9D114 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hddc3Q9D114 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hddc3Q9D114 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hddc3Q9D114 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hddc3Q9D114 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hddc3Q9D114 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hddc3Q9D114 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hddc3Q9D114 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hddc3Q9D114 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hddc3Q9D114 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hddc3Q9D114 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hddc3Q9D114 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hddc3Q9D114 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hddc3Q9D114 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hddc3Q9D114 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hddc3Q9D114 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hddc3Q9D114 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hddc3Q9D114 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hddc3Q9D114 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hddc3Q9D114 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hddc3Q9D114 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hddc3Q9D114 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hddc3Q9D114 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hddc3Q9D114 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hddc3Q9D114 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hddc3Q9D114 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hddc3Q9D114 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hddc3Q9D114 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hddc3Q9D114 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Hddc3Q9D114 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hddc3Q9D114 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hddc3Q9D114 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hddc3Q9D114 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hddc3Q9D114 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hddc3Q9D114 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hddc3Q9D114 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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