Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ13

Uqcrc1, Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uqcrc1Q9CZ13 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uqcrc1Q9CZ13 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Uqcrc1Q9CZ13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uqcrc1Q9CZ13 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uqcrc1Q9CZ13 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uqcrc1Q9CZ13 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uqcrc1Q9CZ13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uqcrc1Q9CZ13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uqcrc1Q9CZ13 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uqcrc1Q9CZ13 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uqcrc1Q9CZ13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uqcrc1Q9CZ13 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uqcrc1Q9CZ13 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uqcrc1Q9CZ13 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Uqcrc1Q9CZ13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Uqcrc1Q9CZ13 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Uqcrc1Q9CZ13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uqcrc1Q9CZ13 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uqcrc1Q9CZ13 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uqcrc1Q9CZ13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uqcrc1Q9CZ13 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uqcrc1Q9CZ13 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Uqcrc1Q9CZ13 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uqcrc1Q9CZ13 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Uqcrc1Q9CZ13 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Uqcrc1Q9CZ13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Uqcrc1Q9CZ13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uqcrc1Q9CZ13 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Uqcrc1Q9CZ13 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Uqcrc1Q9CZ13 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms