Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx2Q9CWK8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Snx2Q9CWK8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx2Q9CWK8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Snx2Q9CWK8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx2Q9CWK8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Snx2Q9CWK8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Snx2Q9CWK8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Snx2Q9CWK8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx2Q9CWK8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Snx2Q9CWK8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Snx2Q9CWK8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx2Q9CWK8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx2Q9CWK8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Snx2Q9CWK8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Snx2Q9CWK8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Snx2Q9CWK8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Snx2Q9CWK8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Snx2Q9CWK8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Snx2Q9CWK8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx2Q9CWK8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Snx2Q9CWK8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Snx2Q9CWK8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Snx2Q9CWK8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx2Q9CWK8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Snx2Q9CWK8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx2Q9CWK8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Snx2Q9CWK8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx2Q9CWK8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx2Q9CWK8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Snx2Q9CWK8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Snx2Q9CWK8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Snx2Q9CWK8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Snx2Q9CWK8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx2Q9CWK8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx2Q9CWK8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx2Q9CWK8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Snx2Q9CWK8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx2Q9CWK8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Snx2Q9CWK8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx2Q9CWK8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx2Q9CWK8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Snx2Q9CWK8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx2Q9CWK8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx2Q9CWK8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx2Q9CWK8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx2Q9CWK8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx2Q9CWK8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms