Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
BccipQ9CWI3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,59■■■□□ 2,33
BccipQ9CWI3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,57■■■□□ 2,32
BccipQ9CWI3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
BccipQ9CWI3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
BccipQ9CWI3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
BccipQ9CWI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
BccipQ9CWI3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
BccipQ9CWI3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
BccipQ9CWI3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
BccipQ9CWI3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
BccipQ9CWI3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
BccipQ9CWI3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,48■■■□□ 2,31
BccipQ9CWI3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
BccipQ9CWI3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
BccipQ9CWI3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
BccipQ9CWI3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
BccipQ9CWI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
BccipQ9CWI3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
BccipQ9CWI3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
BccipQ9CWI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
BccipQ9CWI3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
BccipQ9CWI3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
BccipQ9CWI3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,26■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
BccipQ9CWI3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29,19■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
BccipQ9CWI3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
BccipQ9CWI3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,11■■■□□ 2,25
BccipQ9CWI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
BccipQ9CWI3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
BccipQ9CWI3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,08■■■□□ 2,25
BccipQ9CWI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
BccipQ9CWI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
BccipQ9CWI3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
BccipQ9CWI3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
BccipQ9CWI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
BccipQ9CWI3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,96■■■□□ 2,23
BccipQ9CWI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
BccipQ9CWI3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
BccipQ9CWI3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
BccipQ9CWI3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
BccipQ9CWI3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
BccipQ9CWI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
BccipQ9CWI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
BccipQ9CWI3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
BccipQ9CWI3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
BccipQ9CWI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms