Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CQF4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CQF4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Q9CQF4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Q9CQF4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q9CQF4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q9CQF4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQF4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQF4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Q9CQF4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Q9CQF4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQF4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQF4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Q9CQF4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CQF4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CQF4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Q9CQF4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Q9CQF4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Q9CQF4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Q9CQF4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CQF4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q9CQF4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9CQF4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9CQF4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Q9CQF4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CQF4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9CQF4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9CQF4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CQF4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CQF4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9CQF4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9CQF4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQF4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9CQF4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQF4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQF4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9CQF4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQF4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9CQF4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q9CQF4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CQF4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q9CQF4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQF4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q9CQF4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9CQF4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9CQF4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9CQF4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q9CQF4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQF4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q9CQF4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q9CQF4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q9CQF4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q9CQF4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q9CQF4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms