Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Atp6v0e1Q9CQD8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20,74■□□□□ 0,91
Atp6v0e1Q9CQD8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Atp6v0e1Q9CQD8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Atp6v0e1Q9CQD8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Atp6v0e1Q9CQD8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20,67■□□□□ 0,9
Atp6v0e1Q9CQD8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Atp6v0e1Q9CQD8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20,61■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Atp6v0e1Q9CQD8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20,49■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Atp6v0e1Q9CQD8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Atp6v0e1Q9CQD8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Atp6v0e1Q9CQD8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Atp6v0e1Q9CQD8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,36■□□□□ 0,85
Atp6v0e1Q9CQD8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Atp6v0e1Q9CQD8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20,34■□□□□ 0,85
Atp6v0e1Q9CQD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,84
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Atp6v0e1Q9CQD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,29■□□□□ 0,84
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Atp6v0e1Q9CQD8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Atp6v0e1Q9CQD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,25■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,23■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,18■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20,18■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20,17■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20,14■□□□□ 0,81
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Atp6v0e1Q9CQD8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,12■□□□□ 0,81
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms