Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 CD81-203ENST00000464784 794 ntTSL 525.74■■□□□ 1.714e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.444e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.34e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 522.61■■□□□ 1.214e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.134e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.074e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.024e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.947e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.937e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.927e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 CD81-213ENST00000527343 720 ntTSL 320.58■□□□□ 0.894e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 320.43■□□□□ 0.864e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 CD81-205ENST00000475945 606 ntTSL 220.43■□□□□ 0.864e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.854e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 ANAPC2-203ENST00000483432 793 ntTSL 220.38■□□□□ 0.854e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-213ENST00000590313 1919 ntTSL 220.25■□□□□ 0.837e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.757e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.67e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 517.63■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.327e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.227e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 CD81-215ENST00000530648 558 ntTSL 415.92■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.144e-9■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.067e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 42.5
FTOQ9C0B1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.773e-9■■■■■ 42.4
FTOQ9C0B1 CCDC88A-211ENST00000471947 3713 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.23e-11■■■■■ 41.9
FTOQ9C0B1 CCDC88A-214ENST00000621814 3089 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.043e-11■■■■■ 41.9
FTOQ9C0B1 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-11■■■■■ 41.9
FTOQ9C0B1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-11■■■■■ 41.9
FTOQ9C0B1 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.323e-11■■■■■ 41.9
FTOQ9C0B1 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.643e-11■■■■■ 41.9
FTOQ9C0B1 MLF1-215ENST00000498592 707 ntTSL 321.7■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 41.8
FTOQ9C0B1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 41.8
FTOQ9C0B1 MLF1-212ENST00000491767 787 ntTSL 1 (best)19.02■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 41.8
FTOQ9C0B1 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 41.8
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FTOQ9C0B1 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 41.8
FTOQ9C0B1 MLF1-214ENST00000497004 3048 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 41.8
FTOQ9C0B1 MLF1-213ENST00000495452 742 ntTSL 39.61□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 41.8
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FTOQ9C0B1 MLF1-204ENST00000466246 653 ntTSL 23.21□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 41.8
FTOQ9C0B1 MLF1-211ENST00000487838 473 ntTSL 22.93□□□□□ -1.941e-6■■■■■ 41.8
FTOQ9C0B1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.32e-9■■■■■ 41.2
FTOQ9C0B1 TATDN2-204ENST00000496355 1456 ntTSL 319.28■□□□□ 0.682e-9■■■■■ 41.2
FTOQ9C0B1 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 41.2
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FTOQ9C0B1 AC022384.1-201ENST00000437082 2270 ntAPPRIS P5 TSL 212.8□□□□□ -0.362e-9■■■■■ 41.2
FTOQ9C0B1 TATDN2-203ENST00000448281 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-9■■■■■ 41.2
FTOQ9C0B1 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 41.2
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FTOQ9C0B1 ANTXR2-209ENST00000514959 579 ntTSL 22.36□□□□□ -2.032e-9■■■■■ 41.2
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FTOQ9C0B1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 40.2
FTOQ9C0B1 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.196e-7■■■■■ 40.2
FTOQ9C0B1 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 40.2
FTOQ9C0B1 DCUN1D4-204ENST00000477560 4840 ntTSL 24.94□□□□□ -1.626e-7■■■■■ 40.2
FTOQ9C0B1 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)23.07■■□□□ 1.289e-7■■■■■ 40.2
FTOQ9C0B1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.279e-7■■■■■ 40.2
FTOQ9C0B1 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 216.24■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 40.2
FTOQ9C0B1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.384e-10■■■■■ 40
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FTOQ9C0B1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.253e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.733e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 219.2■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 418.04■□□□□ 0.483e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 317.22■□□□□ 0.353e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 216.61■□□□□ 0.253e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 516.61■□□□□ 0.253e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 215.72■□□□□ 0.113e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-218ENST00000581655 549 ntTSL 415.07■□□□□ 04e-6■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 414.23□□□□□ -0.134e-6■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 512.61□□□□□ -0.393e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 CSNK1D-210ENST00000579308 598 ntTSL 212.44□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 39.9
FTOQ9C0B1 COL18A1-207ENST00000473212 2515 ntTSL 224.93■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 39.4
FTOQ9C0B1 COL18A1-205ENST00000423214 839 ntTSL 518.81■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 39.4
FTOQ9C0B1 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 215.2■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 39.4
FTOQ9C0B1 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 412.08□□□□□ -0.487e-10■■■■■ 39.4
FTOQ9C0B1 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 229.87■■■□□ 2.375e-9■■■■■ 39.3
FTOQ9C0B1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.685e-9■■■■■ 39.3
FTOQ9C0B1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.185e-9■■■■■ 39.3
FTOQ9C0B1 ELOC-210ENST00000622804 1976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.265e-9■■■■■ 39.3
FTOQ9C0B1 ELOC-208ENST00000523815 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.415e-9■■■■■ 39.3
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