Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPS25Q9BRG1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VPS25Q9BRG1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VPS25Q9BRG1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VPS25Q9BRG1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS25Q9BRG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
VPS25Q9BRG1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VPS25Q9BRG1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VPS25Q9BRG1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VPS25Q9BRG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms