Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Tcam1Q99NB3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Tcam1Q99NB3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Tcam1Q99NB3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Tcam1Q99NB3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tcam1Q99NB3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tcam1Q99NB3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Tcam1Q99NB3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Tcam1Q99NB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Tcam1Q99NB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Tcam1Q99NB3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tcam1Q99NB3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Tcam1Q99NB3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Tcam1Q99NB3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tcam1Q99NB3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Tcam1Q99NB3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Tcam1Q99NB3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Tcam1Q99NB3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tcam1Q99NB3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Tcam1Q99NB3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tcam1Q99NB3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Tcam1Q99NB3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Tcam1Q99NB3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Tcam1Q99NB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tcam1Q99NB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Tcam1Q99NB3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tcam1Q99NB3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Tcam1Q99NB3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Tcam1Q99NB3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Tcam1Q99NB3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Tcam1Q99NB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Tcam1Q99NB3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,68
Tcam1Q99NB3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Tcam1Q99NB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Tcam1Q99NB3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Tcam1Q99NB3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Tcam1Q99NB3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Tcam1Q99NB3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tcam1Q99NB3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Tcam1Q99NB3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Tcam1Q99NB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Tcam1Q99NB3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,21■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Tcam1Q99NB3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Tcam1Q99NB3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,5 ms