Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Acss1Q99NB1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Acss1Q99NB1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acss1Q99NB1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Acss1Q99NB1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acss1Q99NB1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Acss1Q99NB1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Acss1Q99NB1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Acss1Q99NB1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acss1Q99NB1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Acss1Q99NB1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Acss1Q99NB1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acss1Q99NB1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Acss1Q99NB1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acss1Q99NB1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acss1Q99NB1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Acss1Q99NB1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Acss1Q99NB1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acss1Q99NB1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Acss1Q99NB1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acss1Q99NB1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acss1Q99NB1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Acss1Q99NB1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Acss1Q99NB1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Acss1Q99NB1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Acss1Q99NB1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Acss1Q99NB1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Acss1Q99NB1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Acss1Q99NB1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acss1Q99NB1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Acss1Q99NB1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Acss1Q99NB1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Acss1Q99NB1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Acss1Q99NB1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Acss1Q99NB1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Acss1Q99NB1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Acss1Q99NB1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Acss1Q99NB1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acss1Q99NB1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Acss1Q99NB1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acss1Q99NB1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Acss1Q99NB1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Acss1Q99NB1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Acss1Q99NB1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Acss1Q99NB1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms