Protein–RNA interactions for Protein: Q99N57

Raf1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raf1Q99N57 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raf1Q99N57 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raf1Q99N57 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Raf1Q99N57 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raf1Q99N57 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raf1Q99N57 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Raf1Q99N57 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Raf1Q99N57 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Raf1Q99N57 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Raf1Q99N57 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Raf1Q99N57 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Raf1Q99N57 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Raf1Q99N57 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Raf1Q99N57 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Raf1Q99N57 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Raf1Q99N57 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Raf1Q99N57 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Raf1Q99N57 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Raf1Q99N57 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Raf1Q99N57 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Raf1Q99N57 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms