Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR9

Ppp1r3a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3aQ99MR9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r3aQ99MR9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ppp1r3aQ99MR9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp1r3aQ99MR9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ppp1r3aQ99MR9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ppp1r3aQ99MR9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ppp1r3aQ99MR9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ppp1r3aQ99MR9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Ppp1r3aQ99MR9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r3aQ99MR9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ppp1r3aQ99MR9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ppp1r3aQ99MR9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ppp1r3aQ99MR9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ppp1r3aQ99MR9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ppp1r3aQ99MR9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ppp1r3aQ99MR9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppp1r3aQ99MR9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppp1r3aQ99MR9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppp1r3aQ99MR9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3aQ99MR9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3aQ99MR9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3aQ99MR9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ppp1r3aQ99MR9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ppp1r3aQ99MR9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r3aQ99MR9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ppp1r3aQ99MR9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ppp1r3aQ99MR9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ppp1r3aQ99MR9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp1r3aQ99MR9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp1r3aQ99MR9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp1r3aQ99MR9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp1r3aQ99MR9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp1r3aQ99MR9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r3aQ99MR9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r3aQ99MR9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp1r3aQ99MR9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp1r3aQ99MR9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp1r3aQ99MR9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ppp1r3aQ99MR9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppp1r3aQ99MR9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r3aQ99MR9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r3aQ99MR9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp1r3aQ99MR9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp1r3aQ99MR9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp1r3aQ99MR9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r3aQ99MR9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r3aQ99MR9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp1r3aQ99MR9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3aQ99MR9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp1r3aQ99MR9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r3aQ99MR9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppp1r3aQ99MR9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppp1r3aQ99MR9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppp1r3aQ99MR9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms