Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gdpd3Q99LY2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gdpd3Q99LY2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdpd3Q99LY2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdpd3Q99LY2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdpd3Q99LY2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdpd3Q99LY2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdpd3Q99LY2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdpd3Q99LY2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd3Q99LY2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd3Q99LY2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdpd3Q99LY2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gdpd3Q99LY2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdpd3Q99LY2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gdpd3Q99LY2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gdpd3Q99LY2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gdpd3Q99LY2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gdpd3Q99LY2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gdpd3Q99LY2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gdpd3Q99LY2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gdpd3Q99LY2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gdpd3Q99LY2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gdpd3Q99LY2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gdpd3Q99LY2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd3Q99LY2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd3Q99LY2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gdpd3Q99LY2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gdpd3Q99LY2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gdpd3Q99LY2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdpd3Q99LY2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gdpd3Q99LY2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdpd3Q99LY2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdpd3Q99LY2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gdpd3Q99LY2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gdpd3Q99LY2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gdpd3Q99LY2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gdpd3Q99LY2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms