Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Pdxdc1Q99K01 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Pdxdc1Q99K01 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Pdxdc1Q99K01 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Pdxdc1Q99K01 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pdxdc1Q99K01 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pdxdc1Q99K01 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Pdxdc1Q99K01 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Pdxdc1Q99K01 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Pdxdc1Q99K01 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Pdxdc1Q99K01 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Pdxdc1Q99K01 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pdxdc1Q99K01 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pdxdc1Q99K01 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Pdxdc1Q99K01 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Pdxdc1Q99K01 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Pdxdc1Q99K01 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pdxdc1Q99K01 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pdxdc1Q99K01 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Pdxdc1Q99K01 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Pdxdc1Q99K01 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pdxdc1Q99K01 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Pdxdc1Q99K01 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pdxdc1Q99K01 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pdxdc1Q99K01 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Pdxdc1Q99K01 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pdxdc1Q99K01 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pdxdc1Q99K01 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Pdxdc1Q99K01 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Pdxdc1Q99K01 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Pdxdc1Q99K01 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Pdxdc1Q99K01 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pdxdc1Q99K01 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pdxdc1Q99K01 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Pdxdc1Q99K01 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Pdxdc1Q99K01 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Pdxdc1Q99K01 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,81■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,88
Pdxdc1Q99K01 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Pdxdc1Q99K01 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Pdxdc1Q99K01 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Pdxdc1Q99K01 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Pdxdc1Q99K01 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Pdxdc1Q99K01 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Pdxdc1Q99K01 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pdxdc1Q99K01 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pdxdc1Q99K01 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Pdxdc1Q99K01 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Pdxdc1Q99K01 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Pdxdc1Q99K01 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Pdxdc1Q99K01 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Pdxdc1Q99K01 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Pdxdc1Q99K01 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms