Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nrbp1Q99J45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nrbp1Q99J45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nrbp1Q99J45 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Nrbp1Q99J45 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Nrbp1Q99J45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Nrbp1Q99J45 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Nrbp1Q99J45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Nrbp1Q99J45 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Nrbp1Q99J45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Nrbp1Q99J45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Nrbp1Q99J45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Nrbp1Q99J45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Nrbp1Q99J45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Nrbp1Q99J45 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Nrbp1Q99J45 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Nrbp1Q99J45 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Nrbp1Q99J45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Nrbp1Q99J45 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Nrbp1Q99J45 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Nrbp1Q99J45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Nrbp1Q99J45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,32
Nrbp1Q99J45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Nrbp1Q99J45 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Nrbp1Q99J45 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Nrbp1Q99J45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Nrbp1Q99J45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Nrbp1Q99J45 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Nrbp1Q99J45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Nrbp1Q99J45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Nrbp1Q99J45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Nrbp1Q99J45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Nrbp1Q99J45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Nrbp1Q99J45 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Nrbp1Q99J45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Nrbp1Q99J45 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Nrbp1Q99J45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Nrbp1Q99J45 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Nrbp1Q99J45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Nrbp1Q99J45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Nrbp1Q99J45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Nrbp1Q99J45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Nrbp1Q99J45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Nrbp1Q99J45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Nrbp1Q99J45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Nrbp1Q99J45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Nrbp1Q99J45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Nrbp1Q99J45 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Nrbp1Q99J45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,19■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,16■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Nrbp1Q99J45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Nrbp1Q99J45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Nrbp1Q99J45 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Nrbp1Q99J45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Nrbp1Q99J45 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Nrbp1Q99J45 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Nrbp1Q99J45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,01■■■□□ 2,24
Nrbp1Q99J45 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Nrbp1Q99J45 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Nrbp1Q99J45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Nrbp1Q99J45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Nrbp1Q99J45 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Nrbp1Q99J45 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Nrbp1Q99J45 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Nrbp1Q99J45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Nrbp1Q99J45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Nrbp1Q99J45 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,7 ms