Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc1Q91Z38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ttc1Q91Z38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ttc1Q91Z38 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc1Q91Z38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ttc1Q91Z38 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ttc1Q91Z38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc1Q91Z38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ttc1Q91Z38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc1Q91Z38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ttc1Q91Z38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ttc1Q91Z38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ttc1Q91Z38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ttc1Q91Z38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc1Q91Z38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ttc1Q91Z38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ttc1Q91Z38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ttc1Q91Z38 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ttc1Q91Z38 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc1Q91Z38 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ttc1Q91Z38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ttc1Q91Z38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ttc1Q91Z38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ttc1Q91Z38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc1Q91Z38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ttc1Q91Z38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ttc1Q91Z38 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ttc1Q91Z38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ttc1Q91Z38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ttc1Q91Z38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ttc1Q91Z38 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ttc1Q91Z38 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc1Q91Z38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ttc1Q91Z38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ttc1Q91Z38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc1Q91Z38 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ttc1Q91Z38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ttc1Q91Z38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ttc1Q91Z38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ttc1Q91Z38 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ttc1Q91Z38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc1Q91Z38 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ttc1Q91Z38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc1Q91Z38 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ttc1Q91Z38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ttc1Q91Z38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ttc1Q91Z38 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ttc1Q91Z38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc1Q91Z38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc1Q91Z38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ttc1Q91Z38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ttc1Q91Z38 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ttc1Q91Z38 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ttc1Q91Z38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc1Q91Z38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ttc1Q91Z38 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ttc1Q91Z38 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ttc1Q91Z38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms