Protein–RNA interactions for Protein: Q91WS2

Nlrp6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp6Q91WS2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nlrp6Q91WS2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nlrp6Q91WS2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nlrp6Q91WS2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Nlrp6Q91WS2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Nlrp6Q91WS2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Nlrp6Q91WS2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Nlrp6Q91WS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Nlrp6Q91WS2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Nlrp6Q91WS2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nlrp6Q91WS2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Nlrp6Q91WS2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Nlrp6Q91WS2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Nlrp6Q91WS2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Nlrp6Q91WS2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Nlrp6Q91WS2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Nlrp6Q91WS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Nlrp6Q91WS2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Nlrp6Q91WS2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Nlrp6Q91WS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Nlrp6Q91WS2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Nlrp6Q91WS2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Nlrp6Q91WS2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Nlrp6Q91WS2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Nlrp6Q91WS2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Nlrp6Q91WS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Nlrp6Q91WS2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nlrp6Q91WS2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nlrp6Q91WS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
Nlrp6Q91WS2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Nlrp6Q91WS2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Nlrp6Q91WS2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nlrp6Q91WS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nlrp6Q91WS2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nlrp6Q91WS2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nlrp6Q91WS2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nlrp6Q91WS2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nlrp6Q91WS2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Nlrp6Q91WS2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nlrp6Q91WS2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nlrp6Q91WS2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Nlrp6Q91WS2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Nlrp6Q91WS2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nlrp6Q91WS2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nlrp6Q91WS2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nlrp6Q91WS2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nlrp6Q91WS2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Nlrp6Q91WS2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nlrp6Q91WS2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nlrp6Q91WS2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nlrp6Q91WS2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nlrp6Q91WS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nlrp6Q91WS2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nlrp6Q91WS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Nlrp6Q91WS2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nlrp6Q91WS2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nlrp6Q91WS2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nlrp6Q91WS2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nlrp6Q91WS2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Nlrp6Q91WS2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nlrp6Q91WS2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nlrp6Q91WS2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 454.7 ms