Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K2

Irak4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak4Q8R4K2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Irak4Q8R4K2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Irak4Q8R4K2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Irak4Q8R4K2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Irak4Q8R4K2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,79■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Irak4Q8R4K2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,71■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,71■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Irak4Q8R4K2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Irak4Q8R4K2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Irak4Q8R4K2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Irak4Q8R4K2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Irak4Q8R4K2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Irak4Q8R4K2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Irak4Q8R4K2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
Irak4Q8R4K2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
Irak4Q8R4K2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Irak4Q8R4K2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Irak4Q8R4K2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Irak4Q8R4K2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Irak4Q8R4K2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Irak4Q8R4K2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Irak4Q8R4K2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Irak4Q8R4K2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Irak4Q8R4K2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Irak4Q8R4K2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Irak4Q8R4K2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Irak4Q8R4K2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Irak4Q8R4K2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Irak4Q8R4K2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,33■■□□□ 1,49
Irak4Q8R4K2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Irak4Q8R4K2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Irak4Q8R4K2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,21■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Irak4Q8R4K2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Irak4Q8R4K2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Irak4Q8R4K2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Irak4Q8R4K2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Irak4Q8R4K2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,11■■□□□ 1,45
Irak4Q8R4K2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Irak4Q8R4K2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Irak4Q8R4K2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Irak4Q8R4K2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Irak4Q8R4K2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms