Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f2Q8R0A0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2f2Q8R0A0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f2Q8R0A0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2f2Q8R0A0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f2Q8R0A0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2f2Q8R0A0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2f2Q8R0A0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Gtf2f2Q8R0A0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2f2Q8R0A0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2f2Q8R0A0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f2Q8R0A0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf2f2Q8R0A0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf2f2Q8R0A0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf2f2Q8R0A0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f2Q8R0A0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f2Q8R0A0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf2f2Q8R0A0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f2Q8R0A0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf2f2Q8R0A0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f2Q8R0A0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf2f2Q8R0A0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f2Q8R0A0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf2f2Q8R0A0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gtf2f2Q8R0A0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gtf2f2Q8R0A0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gtf2f2Q8R0A0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f2Q8R0A0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f2Q8R0A0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gtf2f2Q8R0A0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf2f2Q8R0A0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf2f2Q8R0A0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2f2Q8R0A0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf2f2Q8R0A0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf2f2Q8R0A0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gtf2f2Q8R0A0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gtf2f2Q8R0A0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gtf2f2Q8R0A0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gtf2f2Q8R0A0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gtf2f2Q8R0A0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms