Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Z9

Pom121, Nuclear envelope pore membrane protein POM 121, mousemouse

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pom121Q8K3Z9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pom121Q8K3Z9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pom121Q8K3Z9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pom121Q8K3Z9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pom121Q8K3Z9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pom121Q8K3Z9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pom121Q8K3Z9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pom121Q8K3Z9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pom121Q8K3Z9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pom121Q8K3Z9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pom121Q8K3Z9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pom121Q8K3Z9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pom121Q8K3Z9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pom121Q8K3Z9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pom121Q8K3Z9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pom121Q8K3Z9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pom121Q8K3Z9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pom121Q8K3Z9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pom121Q8K3Z9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pom121Q8K3Z9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pom121Q8K3Z9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pom121Q8K3Z9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pom121Q8K3Z9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pom121Q8K3Z9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pom121Q8K3Z9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pom121Q8K3Z9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pom121Q8K3Z9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pom121Q8K3Z9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pom121Q8K3Z9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pom121Q8K3Z9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pom121Q8K3Z9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pom121Q8K3Z9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pom121Q8K3Z9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pom121Q8K3Z9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pom121Q8K3Z9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pom121Q8K3Z9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pom121Q8K3Z9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pom121Q8K3Z9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pom121Q8K3Z9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pom121Q8K3Z9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pom121Q8K3Z9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pom121Q8K3Z9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pom121Q8K3Z9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pom121Q8K3Z9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pom121Q8K3Z9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pom121Q8K3Z9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms