Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxo18Q8K2I9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxo18Q8K2I9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Fbxo18Q8K2I9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Fbxo18Q8K2I9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Fbxo18Q8K2I9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo18Q8K2I9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo18Q8K2I9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fbxo18Q8K2I9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Fbxo18Q8K2I9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Fbxo18Q8K2I9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Fbxo18Q8K2I9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Fbxo18Q8K2I9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fbxo18Q8K2I9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Fbxo18Q8K2I9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fbxo18Q8K2I9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fbxo18Q8K2I9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Fbxo18Q8K2I9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fbxo18Q8K2I9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Fbxo18Q8K2I9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Fbxo18Q8K2I9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Fbxo18Q8K2I9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Fbxo18Q8K2I9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Fbxo18Q8K2I9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fbxo18Q8K2I9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Fbxo18Q8K2I9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo18Q8K2I9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Fbxo18Q8K2I9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Fbxo18Q8K2I9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fbxo18Q8K2I9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Fbxo18Q8K2I9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fbxo18Q8K2I9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fbxo18Q8K2I9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo18Q8K2I9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo18Q8K2I9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fbxo18Q8K2I9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Fbxo18Q8K2I9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fbxo18Q8K2I9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fbxo18Q8K2I9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Fbxo18Q8K2I9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fbxo18Q8K2I9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fbxo18Q8K2I9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fbxo18Q8K2I9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fbxo18Q8K2I9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fbxo18Q8K2I9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fbxo18Q8K2I9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
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