Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cldn34c1Q8K193 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn34c1Q8K193 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn34c1Q8K193 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn34c1Q8K193 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34c1Q8K193 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn34c1Q8K193 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn34c1Q8K193 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cldn34c1Q8K193 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34c1Q8K193 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34c1Q8K193 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cldn34c1Q8K193 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms