Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt33aQ8K0Y2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt33aQ8K0Y2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt33aQ8K0Y2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt33aQ8K0Y2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt33aQ8K0Y2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt33aQ8K0Y2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt33aQ8K0Y2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt33aQ8K0Y2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt33aQ8K0Y2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt33aQ8K0Y2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt33aQ8K0Y2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt33aQ8K0Y2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt33aQ8K0Y2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt33aQ8K0Y2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt33aQ8K0Y2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt33aQ8K0Y2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt33aQ8K0Y2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt33aQ8K0Y2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt33aQ8K0Y2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt33aQ8K0Y2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt33aQ8K0Y2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt33aQ8K0Y2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt33aQ8K0Y2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt33aQ8K0Y2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt33aQ8K0Y2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt33aQ8K0Y2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt33aQ8K0Y2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt33aQ8K0Y2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt33aQ8K0Y2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt33aQ8K0Y2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Krt33aQ8K0Y2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt33aQ8K0Y2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Krt33aQ8K0Y2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt33aQ8K0Y2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt33aQ8K0Y2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt33aQ8K0Y2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt33aQ8K0Y2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt33aQ8K0Y2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt33aQ8K0Y2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt33aQ8K0Y2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt33aQ8K0Y2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms