Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0Y2

Krt33a, Keratin, type I cuticular Ha3-I, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33aQ8K0Y2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Krt33aQ8K0Y2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Krt33aQ8K0Y2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krt33aQ8K0Y2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Krt33aQ8K0Y2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Krt33aQ8K0Y2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Krt33aQ8K0Y2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Krt33aQ8K0Y2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Krt33aQ8K0Y2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt33aQ8K0Y2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt33aQ8K0Y2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt33aQ8K0Y2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt33aQ8K0Y2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krt33aQ8K0Y2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt33aQ8K0Y2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt33aQ8K0Y2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt33aQ8K0Y2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt33aQ8K0Y2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt33aQ8K0Y2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt33aQ8K0Y2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt33aQ8K0Y2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt33aQ8K0Y2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Krt33aQ8K0Y2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Krt33aQ8K0Y2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Krt33aQ8K0Y2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Krt33aQ8K0Y2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Krt33aQ8K0Y2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Krt33aQ8K0Y2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Krt33aQ8K0Y2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt33aQ8K0Y2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Krt33aQ8K0Y2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt33aQ8K0Y2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt33aQ8K0Y2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt33aQ8K0Y2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt33aQ8K0Y2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt33aQ8K0Y2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt33aQ8K0Y2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt33aQ8K0Y2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt33aQ8K0Y2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt33aQ8K0Y2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt33aQ8K0Y2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt33aQ8K0Y2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt33aQ8K0Y2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt33aQ8K0Y2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt33aQ8K0Y2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt33aQ8K0Y2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt33aQ8K0Y2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt33aQ8K0Y2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt33aQ8K0Y2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt33aQ8K0Y2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt33aQ8K0Y2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt33aQ8K0Y2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt33aQ8K0Y2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt33aQ8K0Y2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt33aQ8K0Y2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt33aQ8K0Y2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt33aQ8K0Y2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt33aQ8K0Y2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt33aQ8K0Y2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Krt33aQ8K0Y2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krt33aQ8K0Y2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt33aQ8K0Y2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt33aQ8K0Y2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt33aQ8K0Y2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt33aQ8K0Y2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt33aQ8K0Y2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt33aQ8K0Y2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt33aQ8K0Y2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt33aQ8K0Y2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt33aQ8K0Y2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt33aQ8K0Y2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt33aQ8K0Y2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt33aQ8K0Y2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt33aQ8K0Y2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt33aQ8K0Y2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt33aQ8K0Y2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt33aQ8K0Y2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt33aQ8K0Y2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt33aQ8K0Y2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt33aQ8K0Y2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt33aQ8K0Y2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt33aQ8K0Y2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt33aQ8K0Y2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt33aQ8K0Y2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt33aQ8K0Y2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt33aQ8K0Y2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt33aQ8K0Y2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt33aQ8K0Y2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt33aQ8K0Y2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt33aQ8K0Y2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt33aQ8K0Y2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt33aQ8K0Y2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt33aQ8K0Y2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt33aQ8K0Y2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt33aQ8K0Y2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt33aQ8K0Y2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt33aQ8K0Y2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt33aQ8K0Y2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt33aQ8K0Y2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt33aQ8K0Y2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms