Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q8K039 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q8K039 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q8K039 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q8K039 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q8K039 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q8K039 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8K039 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q8K039 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8K039 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q8K039 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8K039 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8K039 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8K039 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q8K039 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8K039 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q8K039 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q8K039 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q8K039 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8K039 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q8K039 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8K039 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8K039 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8K039 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8K039 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q8K039 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q8K039 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8K039 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q8K039 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Q8K039 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q8K039 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q8K039 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q8K039 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q8K039 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q8K039 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q8K039 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8K039 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8K039 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q8K039 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q8K039 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q8K039 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q8K039 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q8K039 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8K039 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q8K039 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q8K039 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q8K039 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Q8K039 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8K039 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q8K039 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8K039 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q8K039 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8K039 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q8K039 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q8K039 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q8K039 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q8K039 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q8K039 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Q8K039 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q8K039 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8K039 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q8K039 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q8K039 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8K039 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8K039 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q8K039 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8K039 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8K039 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q8K039 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Q8K039 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q8K039 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8K039 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8K039 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8K039 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q8K039 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8K039 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q8K039 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8K039 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8K039 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q8K039 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q8K039 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8K039 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8K039 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q8K039 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q8K039 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q8K039 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8K039 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8K039 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q8K039 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8K039 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q8K039 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8K039 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q8K039 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8K039 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8K039 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q8K039 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q8K039 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q8K039 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q8K039 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q8K039 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms