Protein–RNA interactions for Protein: Q8C804

Spice1, Spindle and centriole-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spice1Q8C804 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Spice1Q8C804 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Spice1Q8C804 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Spice1Q8C804 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Spice1Q8C804 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Spice1Q8C804 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Spice1Q8C804 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Spice1Q8C804 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spice1Q8C804 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spice1Q8C804 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Spice1Q8C804 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spice1Q8C804 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Spice1Q8C804 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spice1Q8C804 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spice1Q8C804 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spice1Q8C804 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spice1Q8C804 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spice1Q8C804 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Spice1Q8C804 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Spice1Q8C804 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spice1Q8C804 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Spice1Q8C804 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spice1Q8C804 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spice1Q8C804 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Spice1Q8C804 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spice1Q8C804 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spice1Q8C804 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spice1Q8C804 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Spice1Q8C804 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Spice1Q8C804 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Spice1Q8C804 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Spice1Q8C804 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Spice1Q8C804 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Spice1Q8C804 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Spice1Q8C804 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spice1Q8C804 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Spice1Q8C804 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Spice1Q8C804 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spice1Q8C804 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Spice1Q8C804 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spice1Q8C804 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Spice1Q8C804 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Spice1Q8C804 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spice1Q8C804 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Spice1Q8C804 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spice1Q8C804 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Spice1Q8C804 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spice1Q8C804 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Spice1Q8C804 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Spice1Q8C804 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Spice1Q8C804 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Spice1Q8C804 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spice1Q8C804 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Spice1Q8C804 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms