Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,96■■□□□ 1,11
Ssxb2Q8C5Z3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Ssxb2Q8C5Z3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,94■■□□□ 1,1
Ssxb2Q8C5Z3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Ssxb2Q8C5Z3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21,89■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,87■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,83■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21,83■■□□□ 1,09
Ssxb2Q8C5Z3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Ssxb2Q8C5Z3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Ssxb2Q8C5Z3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Ssxb2Q8C5Z3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21,73■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Ssxb2Q8C5Z3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Ssxb2Q8C5Z3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Ssxb2Q8C5Z3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Ssxb2Q8C5Z3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,63■■□□□ 1,05
Ssxb2Q8C5Z3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Ssxb2Q8C5Z3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ssxb2Q8C5Z3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Ssxb2Q8C5Z3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,58■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Ssxb2Q8C5Z3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21,48■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Ssxb2Q8C5Z3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,4■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Ssxb2Q8C5Z3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Ssxb2Q8C5Z3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21,32■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,31■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21,31■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Ssxb2Q8C5Z3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,29■■□□□ 1
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