Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZ00

Slc9a9, Sodium/hydrogen exchanger 9, mousemouse

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a9Q8BZ00 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc9a9Q8BZ00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slc9a9Q8BZ00 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc9a9Q8BZ00 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc9a9Q8BZ00 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc9a9Q8BZ00 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc9a9Q8BZ00 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc9a9Q8BZ00 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc9a9Q8BZ00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc9a9Q8BZ00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc9a9Q8BZ00 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc9a9Q8BZ00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc9a9Q8BZ00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc9a9Q8BZ00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slc9a9Q8BZ00 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Slc9a9Q8BZ00 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Slc9a9Q8BZ00 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc9a9Q8BZ00 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc9a9Q8BZ00 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc9a9Q8BZ00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc9a9Q8BZ00 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc9a9Q8BZ00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc9a9Q8BZ00 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc9a9Q8BZ00 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc9a9Q8BZ00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc9a9Q8BZ00 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc9a9Q8BZ00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc9a9Q8BZ00 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Slc9a9Q8BZ00 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc9a9Q8BZ00 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc9a9Q8BZ00 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc9a9Q8BZ00 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Slc9a9Q8BZ00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc9a9Q8BZ00 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc9a9Q8BZ00 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Slc9a9Q8BZ00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc9a9Q8BZ00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Slc9a9Q8BZ00 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc9a9Q8BZ00 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Slc9a9Q8BZ00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Slc9a9Q8BZ00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc9a9Q8BZ00 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc9a9Q8BZ00 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc9a9Q8BZ00 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc9a9Q8BZ00 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Slc9a9Q8BZ00 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc9a9Q8BZ00 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc9a9Q8BZ00 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc9a9Q8BZ00 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc9a9Q8BZ00 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc9a9Q8BZ00 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Slc9a9Q8BZ00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Slc9a9Q8BZ00 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Slc9a9Q8BZ00 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Slc9a9Q8BZ00 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Slc9a9Q8BZ00 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc9a9Q8BZ00 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc9a9Q8BZ00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc9a9Q8BZ00 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Slc9a9Q8BZ00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Slc9a9Q8BZ00 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Slc9a9Q8BZ00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc9a9Q8BZ00 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Slc9a9Q8BZ00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc9a9Q8BZ00 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Slc9a9Q8BZ00 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms