Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrfn5Q8BXA0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrfn5Q8BXA0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrfn5Q8BXA0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrfn5Q8BXA0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrfn5Q8BXA0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrfn5Q8BXA0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrfn5Q8BXA0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrfn5Q8BXA0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrfn5Q8BXA0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrfn5Q8BXA0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrfn5Q8BXA0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrfn5Q8BXA0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrfn5Q8BXA0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lrfn5Q8BXA0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrfn5Q8BXA0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lrfn5Q8BXA0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrfn5Q8BXA0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrfn5Q8BXA0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrfn5Q8BXA0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrfn5Q8BXA0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrfn5Q8BXA0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrfn5Q8BXA0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrfn5Q8BXA0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrfn5Q8BXA0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrfn5Q8BXA0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrfn5Q8BXA0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrfn5Q8BXA0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrfn5Q8BXA0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrfn5Q8BXA0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrfn5Q8BXA0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrfn5Q8BXA0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrfn5Q8BXA0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrfn5Q8BXA0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrfn5Q8BXA0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrfn5Q8BXA0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrfn5Q8BXA0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrfn5Q8BXA0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrfn5Q8BXA0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrfn5Q8BXA0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrfn5Q8BXA0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms