Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rbbp5Q8BX09 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Rbbp5Q8BX09 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rbbp5Q8BX09 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Rbbp5Q8BX09 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Rbbp5Q8BX09 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Rbbp5Q8BX09 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rbbp5Q8BX09 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rbbp5Q8BX09 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rbbp5Q8BX09 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rbbp5Q8BX09 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Rbbp5Q8BX09 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rbbp5Q8BX09 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rbbp5Q8BX09 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rbbp5Q8BX09 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rbbp5Q8BX09 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Rbbp5Q8BX09 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Rbbp5Q8BX09 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rbbp5Q8BX09 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rbbp5Q8BX09 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rbbp5Q8BX09 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rbbp5Q8BX09 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rbbp5Q8BX09 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rbbp5Q8BX09 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Rbbp5Q8BX09 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Rbbp5Q8BX09 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rbbp5Q8BX09 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rbbp5Q8BX09 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rbbp5Q8BX09 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rbbp5Q8BX09 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rbbp5Q8BX09 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rbbp5Q8BX09 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Rbbp5Q8BX09 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rbbp5Q8BX09 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Rbbp5Q8BX09 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rbbp5Q8BX09 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
Rbbp5Q8BX09 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Rbbp5Q8BX09 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Rbbp5Q8BX09 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Rbbp5Q8BX09 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Rbbp5Q8BX09 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rbbp5Q8BX09 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rbbp5Q8BX09 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rbbp5Q8BX09 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rbbp5Q8BX09 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rbbp5Q8BX09 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rbbp5Q8BX09 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rbbp5Q8BX09 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rbbp5Q8BX09 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rbbp5Q8BX09 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Rbbp5Q8BX09 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms