Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cdca8Q8BHX3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdca8Q8BHX3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cdca8Q8BHX3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cdca8Q8BHX3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdca8Q8BHX3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cdca8Q8BHX3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Cdca8Q8BHX3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Cdca8Q8BHX3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cdca8Q8BHX3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cdca8Q8BHX3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Cdca8Q8BHX3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cdca8Q8BHX3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cdca8Q8BHX3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cdca8Q8BHX3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cdca8Q8BHX3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdca8Q8BHX3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cdca8Q8BHX3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cdca8Q8BHX3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdca8Q8BHX3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cdca8Q8BHX3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Cdca8Q8BHX3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cdca8Q8BHX3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdca8Q8BHX3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cdca8Q8BHX3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdca8Q8BHX3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cdca8Q8BHX3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cdca8Q8BHX3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdca8Q8BHX3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cdca8Q8BHX3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdca8Q8BHX3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cdca8Q8BHX3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Cdca8Q8BHX3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdca8Q8BHX3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cdca8Q8BHX3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdca8Q8BHX3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cdca8Q8BHX3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdca8Q8BHX3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cdca8Q8BHX3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdca8Q8BHX3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cdca8Q8BHX3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cdca8Q8BHX3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cdca8Q8BHX3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Cdca8Q8BHX3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cdca8Q8BHX3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cdca8Q8BHX3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cdca8Q8BHX3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
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