Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
Clrn3Q8BHH8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Clrn3Q8BHH8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Clrn3Q8BHH8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Clrn3Q8BHH8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,48
Clrn3Q8BHH8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Clrn3Q8BHH8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Clrn3Q8BHH8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Clrn3Q8BHH8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Clrn3Q8BHH8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Clrn3Q8BHH8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Clrn3Q8BHH8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Clrn3Q8BHH8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Clrn3Q8BHH8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Clrn3Q8BHH8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,21■■□□□ 1,47
Clrn3Q8BHH8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
Clrn3Q8BHH8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Clrn3Q8BHH8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Clrn3Q8BHH8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Clrn3Q8BHH8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Clrn3Q8BHH8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Clrn3Q8BHH8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Clrn3Q8BHH8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,08■■□□□ 1,45
Clrn3Q8BHH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Clrn3Q8BHH8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
Clrn3Q8BHH8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Clrn3Q8BHH8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Clrn3Q8BHH8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Clrn3Q8BHH8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Clrn3Q8BHH8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,88■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Clrn3Q8BHH8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23,82■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Clrn3Q8BHH8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Clrn3Q8BHH8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Clrn3Q8BHH8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Clrn3Q8BHH8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Clrn3Q8BHH8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Clrn3Q8BHH8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Clrn3Q8BHH8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,67■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Clrn3Q8BHH8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,59■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Clrn3Q8BHH8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
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