Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE5

Fancm, Fanconi anemia group M protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancmQ8BGE5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FancmQ8BGE5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FancmQ8BGE5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FancmQ8BGE5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FancmQ8BGE5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FancmQ8BGE5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FancmQ8BGE5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FancmQ8BGE5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FancmQ8BGE5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FancmQ8BGE5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancmQ8BGE5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancmQ8BGE5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancmQ8BGE5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancmQ8BGE5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancmQ8BGE5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FancmQ8BGE5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FancmQ8BGE5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FancmQ8BGE5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FancmQ8BGE5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FancmQ8BGE5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FancmQ8BGE5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FancmQ8BGE5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FancmQ8BGE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FancmQ8BGE5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FancmQ8BGE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FancmQ8BGE5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FancmQ8BGE5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FancmQ8BGE5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FancmQ8BGE5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FancmQ8BGE5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms