Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q0

Gm5622, Predicted gene 5622, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5622Q810Q0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm5622Q810Q0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm5622Q810Q0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gm5622Q810Q0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm5622Q810Q0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm5622Q810Q0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gm5622Q810Q0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gm5622Q810Q0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm5622Q810Q0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm5622Q810Q0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm5622Q810Q0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm5622Q810Q0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm5622Q810Q0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm5622Q810Q0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm5622Q810Q0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm5622Q810Q0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm5622Q810Q0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm5622Q810Q0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm5622Q810Q0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm5622Q810Q0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm5622Q810Q0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm5622Q810Q0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm5622Q810Q0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm5622Q810Q0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm5622Q810Q0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm5622Q810Q0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm5622Q810Q0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm5622Q810Q0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm5622Q810Q0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm5622Q810Q0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm5622Q810Q0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm5622Q810Q0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm5622Q810Q0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm5622Q810Q0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm5622Q810Q0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm5622Q810Q0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm5622Q810Q0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm5622Q810Q0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm5622Q810Q0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm5622Q810Q0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm5622Q810Q0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm5622Q810Q0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm5622Q810Q0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gm5622Q810Q0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gm5622Q810Q0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gm5622Q810Q0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm5622Q810Q0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm5622Q810Q0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms