Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zer1Q80ZJ6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zer1Q80ZJ6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zer1Q80ZJ6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zer1Q80ZJ6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zer1Q80ZJ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zer1Q80ZJ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zer1Q80ZJ6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zer1Q80ZJ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zer1Q80ZJ6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zer1Q80ZJ6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zer1Q80ZJ6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zer1Q80ZJ6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zer1Q80ZJ6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zer1Q80ZJ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zer1Q80ZJ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Zer1Q80ZJ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zer1Q80ZJ6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zer1Q80ZJ6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zer1Q80ZJ6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zer1Q80ZJ6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zer1Q80ZJ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zer1Q80ZJ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zer1Q80ZJ6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zer1Q80ZJ6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zer1Q80ZJ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zer1Q80ZJ6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zer1Q80ZJ6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zer1Q80ZJ6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zer1Q80ZJ6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zer1Q80ZJ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms